MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanocella arvoryzae MRE50 chromosome

Total Repeats: 63788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009464	TAA	2	6	1	6	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009464	CTG	2	6	218	223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009464	AT	3	6	241	246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009464	TAA	2	6	258	263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009464	AG	3	6	267	272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009464	CAT	2	6	301	306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918683
7	NC_009464	TC	3	6	383	388	0 %	50 %	0 %	50 %	147918683
8	NC_009464	GCA	2	6	414	419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918683
9	NC_009464	CCGA	2	8	425	432	25 %	0 %	25 %	50 %	147918683
10	NC_009464	CGA	2	6	436	441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918683
11	NC_009464	CGG	2	6	469	474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918683
12	NC_009464	TCC	2	6	486	491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918683
13	NC_009464	CT	3	6	582	587	0 %	50 %	0 %	50 %	147918683
14	NC_009464	ATC	2	6	602	607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918683
15	NC_009464	GGT	2	6	619	624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918683
16	NC_009464	ATGA	2	8	677	684	50 %	25 %	25 %	0 %	147918683
17	NC_009464	AGT	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918683
18	NC_009464	GGA	2	6	754	759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918683
19	NC_009464	GGC	2	6	824	829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918683
20	NC_009464	CAT	3	9	856	864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918683
21	NC_009464	GCCC	2	8	893	900	0 %	0 %	25 %	75 %	147918683
22	NC_009464	GGA	2	6	946	951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918683
23	NC_009464	ACA	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918683
24	NC_009464	C	6	6	1202	1207	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_009464	ATCG	2	8	1283	1290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009464	TCT	2	6	1315	1320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009464	GTGA	2	8	1350	1357	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009464	ATC	2	6	1382	1387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009464	CGT	2	6	1426	1431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009464	GA	3	6	1476	1481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009464	TACAG	2	10	1495	1504	40 %	20 %	20 %	20 %	147918684
32	NC_009464	ATC	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918684
33	NC_009464	GCAGA	2	10	1535	1544	40 %	0 %	40 %	20 %	147918684
34	NC_009464	AGA	3	9	1551	1559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918684
35	NC_009464	GGA	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918684
36	NC_009464	G	6	6	1616	1621	0 %	0 %	100 %	0 %	147918684
37	NC_009464	G	6	6	1666	1671	0 %	0 %	100 %	0 %	147918684
38	NC_009464	AGC	2	6	1692	1697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918684
39	NC_009464	TGA	2	6	1755	1760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918684
40	NC_009464	GCAG	2	8	1828	1835	25 %	0 %	50 %	25 %	147918684
41	NC_009464	TCC	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918684
42	NC_009464	CGG	2	6	1869	1874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918684
43	NC_009464	CAC	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918684
44	NC_009464	ATG	2	6	2021	2026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918684
45	NC_009464	GTT	2	6	2086	2091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147918684
46	NC_009464	GAA	2	6	2120	2125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918684
47	NC_009464	AAGG	2	8	2153	2160	50 %	0 %	50 %	0 %	147918684
48	NC_009464	CTCTGA	2	12	2172	2183	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	147918684
49	NC_009464	CGT	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918684
50	NC_009464	CGA	2	6	2229	2234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918684
51	NC_009464	CGG	2	6	2239	2244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918684
52	NC_009464	CCG	2	6	2352	2357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918684
53	NC_009464	ATC	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918684
54	NC_009464	T	6	6	2415	2420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009464	GAG	2	6	2529	2534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918685
56	NC_009464	AAGCGG	2	12	2541	2552	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	147918685
57	NC_009464	TGC	2	6	2578	2583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918685
58	NC_009464	A	7	7	2728	2734	100 %	0 %	0 %	0 %	147918685
59	NC_009464	GGAT	2	8	2854	2861	25 %	25 %	50 %	0 %	147918685
60	NC_009464	CGG	2	6	2888	2893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918685
61	NC_009464	CCA	2	6	2978	2983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918685
62	NC_009464	GTCA	2	8	2996	3003	25 %	25 %	25 %	25 %	147918685
63	NC_009464	TAC	2	6	3105	3110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918685
64	NC_009464	AAG	2	6	3174	3179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918685
65	NC_009464	GTC	2	6	3285	3290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918685
66	NC_009464	CGG	2	6	3475	3480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009464	ACA	2	6	3503	3508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009464	CGG	2	6	3527	3532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009464	CTT	2	6	3572	3577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009464	CGG	2	6	3588	3593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009464	CGG	2	6	3596	3601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009464	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009464	TAC	2	6	3666	3671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009464	TCA	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009464	ATCG	2	8	3691	3698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009464	ATA	2	6	3746	3751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009464	GCC	2	6	3796	3801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009464	CCACT	2	10	3876	3885	20 %	20 %	0 %	60 %	147918686
79	NC_009464	TCG	2	6	3946	3951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
80	NC_009464	CTT	2	6	4027	4032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918686
81	NC_009464	GTC	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
82	NC_009464	CGGG	2	8	4051	4058	0 %	0 %	75 %	25 %	147918686
83	NC_009464	GCT	2	6	4101	4106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
84	NC_009464	TGC	2	6	4156	4161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
85	NC_009464	AGA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918686
86	NC_009464	CGG	2	6	4366	4371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918686
87	NC_009464	CAG	2	6	4418	4423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
88	NC_009464	TCT	2	6	4524	4529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918686
89	NC_009464	CCGGG	2	10	4558	4567	0 %	0 %	60 %	40 %	147918686
90	NC_009464	GAT	2	6	4679	4684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918686
91	NC_009464	AGC	2	6	4692	4697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
92	NC_009464	AGC	2	6	4878	4883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
93	NC_009464	AGC	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
94	NC_009464	CGC	2	6	5053	5058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918686
95	NC_009464	TGC	2	6	5078	5083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918686
96	NC_009464	TGGC	2	8	5110	5117	0 %	25 %	50 %	25 %	147918686
97	NC_009464	CAG	2	6	5156	5161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
98	NC_009464	TGA	2	6	5269	5274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918686
99	NC_009464	CCAGGT	2	12	5284	5295	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	147918686
100	NC_009464	GAAT	2	8	5311	5318	50 %	25 %	25 %	0 %	147918686
101	NC_009464	CAG	2	6	5354	5359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918686
102	NC_009464	CTT	2	6	5406	5411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918687
103	NC_009464	TTC	2	6	5462	5467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918687
104	NC_009464	CGG	2	6	5501	5506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918687
105	NC_009464	CTGCCG	2	12	5507	5518	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	147918687
106	NC_009464	GAT	2	6	5524	5529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918687
107	NC_009464	TCG	2	6	5561	5566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
108	NC_009464	GAT	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918687
109	NC_009464	TCC	2	6	5729	5734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918687
110	NC_009464	TGC	2	6	5744	5749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
111	NC_009464	CT	3	6	5830	5835	0 %	50 %	0 %	50 %	147918687
112	NC_009464	CTC	2	6	5855	5860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918687
113	NC_009464	GTA	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918687
114	NC_009464	CTT	2	6	5955	5960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918687
115	NC_009464	GCA	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918687
116	NC_009464	TCC	2	6	6089	6094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918687
117	NC_009464	TCG	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
118	NC_009464	GGT	2	6	6174	6179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147918687
119	NC_009464	TCG	2	6	6185	6190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
120	NC_009464	CTC	2	6	6280	6285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918687
121	NC_009464	CCA	2	6	6345	6350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918687
122	NC_009464	CACGAT	2	12	6364	6375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	147918687
123	NC_009464	GCA	2	6	6435	6440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918687
124	NC_009464	CGT	2	6	6549	6554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918687
125	NC_009464	AAT	2	6	6739	6744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009464	CGC	2	6	6751	6756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_009464	AT	3	6	6838	6843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009464	ATATT	3	15	6849	6863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009464	GCG	2	6	6878	6883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918688
130	NC_009464	ACC	2	6	6955	6960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918688
131	NC_009464	GAG	2	6	7075	7080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147918688
132	NC_009464	AAG	2	6	7084	7089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918688
133	NC_009464	ATTG	2	8	7101	7108	25 %	50 %	25 %	0 %	147918688
134	NC_009464	ATC	2	6	7192	7197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918688
135	NC_009464	CAT	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918688
136	NC_009464	GTCT	2	8	7272	7279	0 %	50 %	25 %	25 %	147918688
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141	NC_009464	CGA	2	6	7347	7352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918688
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244	NC_009464	TCA	2	6	12203	12208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918693
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248	NC_009464	CAC	2	6	12424	12429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918693
249	NC_009464	CAAGG	2	10	12522	12531	40 %	0 %	40 %	20 %	147918693
250	NC_009464	GAA	2	6	12543	12548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918693
251	NC_009464	CGT	2	6	12561	12566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918693
252	NC_009464	G	6	6	12588	12593	0 %	0 %	100 %	0 %	147918693
253	NC_009464	CGA	2	6	12633	12638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918693
254	NC_009464	GC	3	6	12692	12697	0 %	0 %	50 %	50 %	147918693
255	NC_009464	GAC	2	6	12862	12867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918693
256	NC_009464	GCG	2	6	12881	12886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918693
257	NC_009464	CCT	2	6	12927	12932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918693
258	NC_009464	CGG	2	6	12996	13001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147918693
259	NC_009464	AC	3	6	13018	13023	50 %	0 %	0 %	50 %	147918693
260	NC_009464	CTT	2	6	13029	13034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918693
261	NC_009464	AAG	2	6	13039	13044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918693
262	NC_009464	CAT	2	6	13050	13055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918693
263	NC_009464	GA	3	6	13083	13088	50 %	0 %	50 %	0 %	147918693
264	NC_009464	T	6	6	13125	13130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_009464	A	7	7	13165	13171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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394	NC_009464	CGA	2	6	19722	19727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918701
395	NC_009464	CCT	2	6	19899	19904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918701
396	NC_009464	GGCT	2	8	19928	19935	0 %	25 %	50 %	25 %	147918701
397	NC_009464	A	6	6	19945	19950	100 %	0 %	0 %	0 %	147918701
398	NC_009464	AAC	2	6	19963	19968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_009464	AGC	2	6	20173	20178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918702
400	NC_009464	GA	3	6	20195	20200	50 %	0 %	50 %	0 %	147918702
401	NC_009464	CGAGG	2	10	20292	20301	20 %	0 %	60 %	20 %	147918702
402	NC_009464	CTT	2	6	20339	20344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147918702
403	NC_009464	TGA	2	6	20345	20350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147918702
404	NC_009464	CCT	2	6	20366	20371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147918702
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408	NC_009464	TAA	2	6	20663	20668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_009464	ATA	2	6	20689	20694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_009464	GGC	2	6	20713	20718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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432	NC_009464	GCG	2	6	21730	21735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_009464	CAGC	2	8	21829	21836	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
434	NC_009464	CTC	2	6	21874	21879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
435	NC_009464	AAG	2	6	21892	21897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
436	NC_009464	GGA	2	6	21981	21986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
437	NC_009464	CGA	2	6	22019	22024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
438	NC_009464	CGGC	2	8	22062	22069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
439	NC_009464	T	6	6	22124	22129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_009464	TAGTGG	2	12	22173	22184	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
441	NC_009464	GA	3	6	22253	22258	50 %	0 %	50 %	0 %	147918704
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470	NC_009464	ATC	2	6	23212	23217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918704
471	NC_009464	ATC	2	6	23269	23274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918704
472	NC_009464	TCTTT	2	10	23425	23434	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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479	NC_009464	GCGCG	2	10	23927	23936	0 %	0 %	60 %	40 %	147918706
480	NC_009464	TCG	2	6	24007	24012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918706
481	NC_009464	CCG	2	6	24019	24024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147918706
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483	NC_009464	CTGTCA	2	12	24118	24129	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	147918706
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485	NC_009464	TAT	2	6	24362	24367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_009464	CAA	3	9	24509	24517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147918707
487	NC_009464	TCG	2	6	24559	24564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147918707
488	NC_009464	ACC	2	6	24599	24604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147918707
489	NC_009464	AG	3	6	24718	24723	50 %	0 %	50 %	0 %	147918707
490	NC_009464	GAA	2	6	24746	24751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918707
491	NC_009464	AAG	2	6	24807	24812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147918707
492	NC_009464	ACG	2	6	24850	24855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918707
493	NC_009464	ACTG	2	8	24886	24893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
494	NC_009464	CTG	2	6	24907	24912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
495	NC_009464	GTA	2	6	24937	24942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
496	NC_009464	GGA	2	6	24964	24969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
497	NC_009464	AAGAA	2	10	24980	24989	80 %	0 %	20 %	0 %	147918708
498	NC_009464	CAG	2	6	25019	25024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147918708
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500	NC_009464	CAT	2	6	25115	25120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147918708

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